Sebagai ibu kota Kabupaten Kulon Progo, Kelurahan Wates menjadi pusat aktivitas ekonomi dan perdagangan. Terdapat pasar tradisional, toko modern, dan beragam usaha mikro kecil menengah (UMKM) yang terus berkembang. Letaknya yang strategis juga mendukung pertumbuhan sektor jasa seperti perbankan, transportasi, dan kuliner.